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    Genomische Datenwissenschaft und Clustering (Bioinformatik V)
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    Genomische Datenwissenschaft und Clustering (Bioinformatik V)

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    Pavel  Pevzner
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    Phillip Compeau
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    Es dauert 9 Stunden
    3 Wochen bei 3 Stunden pro Woche
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    In Ihrem eigenen Lerntempo lernen

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    In diesem Kurs gibt es 3 Module

    Wie können wir feststellen, welche Gene die verschiedenen Prozesse in der Zelle steuern? Wie sind die Menschen aus Afrika ausgewandert und haben sich auf der ganzen Welt ausgebreitet? In diesem Kurs werden wir sehen, dass diese beiden scheinbar unterschiedlichen Fragen mit ähnlichen Algorithmen und Techniken des maschinellen Lernens angegangen werden können, die sich aus dem allgemeinen Problem der Einteilung von Datenpunkten in verschiedene Cluster ergeben. In der ersten Hälfte des Kurses werden wir Algorithmen für das Clustern einer Gruppe von Objekten in eine Sammlung von Clustern auf der Grundlage ihrer Ähnlichkeit vorstellen, ein klassisches Problem der Datenwissenschaft, und sehen, wie diese Algorithmen auf Genexpressionsdaten angewendet werden können.

    In der zweiten Hälfte des Kurses werden wir ein weiteres klassisches Werkzeug der Datenwissenschaft, die Hauptkomponentenanalyse, vorstellen, mit der mehrdimensionale Daten vor dem Clustering vorverarbeitet werden können, um die Anzahl der Dimensionen stark zu reduzieren, ohne dass ein Großteil des "Signals" in den Daten verloren geht. Schließlich werden Sie lernen, wie man gängige Bioinformatik-Softwaretools anwendet, um ein reales Problem beim Clustering zu lösen.

    <p>Willkommen im Kurs!</p><p>Zu Beginn des Kurses werden wir sehen, wie Algorithmen zum&nbsp;<strong>Clustern&nbsp;</strong>einer Reihe von Datenpunkten&nbsp;uns dabei helfen, herauszufinden, wie Hefe zu so guten Weinmachern wurde. Am Ende dieser E-Mail finden Sie den Bioinformatik-Cartoon zu diesem Kapitel, der mit freundlicher Genehmigung von <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> erstellt wurde und als Kapitelüberschrift im Bestseller <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">Print Companion</a> der Specializations dient. Wie konnte der Affe einen Wettbewerb im Weintrinken gegen ein winziges Säugetier verlieren? &nbsp;Warum sind Pavel und Phillip Höhlenmenschen geworden? Und wird das Werfen einer Münze ihnen helfen, ihrer ewigen Langeweile zu entkommen, bis sie in die Gegenwart zurückkehren können? Beginnen Sie zu lernen, um es herauszufinden!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Bild: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>

    Das ist alles enthalten

    5 Videos2 Lektüren1 Aufgabe2 App-Elemente

    5 Videos•Insgesamt 32 Minuten
    • (Sehen Sie sich unser verrücktes Kurseinführungsvideo an!)•3 Minuten•Modulvorschau
    • Welche Hefegene sind für die Weinherstellung verantwortlich?•6 Minuten
    • Genexpressionsmatrizen•6 Minuten
    • Clustering als Optimierungsproblem•10 Minuten
    • Der Lloyd Algorithmus für k-Means Clustering•5 Minuten
    2 Lektüren•Insgesamt 10 Minuten
    • Kurs-Details•10 Minuten
    • Woche 1 FAQs (optional)•0 Minuten
    1 Aufgabe•Insgesamt 20 Minuten
    • Woche 1 Quiz•20 Minuten
    2 App-Elemente•Insgesamt 210 Minuten
    • Öffnen, um Ihren Fortschritt zu synchronisieren: Interaktiver Text für Woche 1•0 Minuten
    • Interaktiver Text für Woche 1•210 Minuten

    <p>Willkommen zu Woche 2 des Kurses!</p> <p>In dieser Woche werden wir sehen, wie wir von einer "harten" Zuordnung von Punkten zu Clustern zu einer "weichen" Zuordnung übergehen können, bei der die Grenzen der Cluster ineinander übergehen können. Wir werden auch sehen, wie wir den Lloyd-Algorithmus, den wir in der ersten Woche kennengelernt haben, anpassen können, um einen Algorithmus für Soft Clustering zu entwickeln. Wir werden auch einen anderen Clustering-Algorithmus kennenlernen, das so genannte "hierarchische Clustering", das Objekte in immer größeren Clustern gruppiert.</p>>>

    Das ist alles enthalten

    5 Videos1 Lektüre1 Aufgabe2 App-Elemente

    5 Videos•Insgesamt 34 Minuten
    • Vom harten zum weichen Clustering•11 Minuten•Modulvorschau
    • Vom Münz-Werfen zum k-Means-Clustering•4 Minuten
    • Maximierung der Erwartung•7 Minuten
    • Soft k-Means Clustering•3 Minuten
    • Hierarchisches Clustering•7 Minuten
    1 Lektüre
    • Woche 2 FAQs (optional)•0 Minuten
    1 Aufgabe•Insgesamt 15 Minuten
    • Woche 2 Quiz•15 Minuten
    2 App-Elemente•Insgesamt 210 Minuten
    • Öffnen, um Ihren Fortschritt zu synchronisieren: Interaktiver Text für Woche 2•0 Minuten
    • Interaktiver Text für Woche 2•210 Minuten

    Das ist alles enthalten

    2 Lektüren1 Aufgabe

    2 Lektüren•Insgesamt 20 Minuten
    • Erklärung zum Material dieser Woche•10 Minuten
    • Wie haben die Menschen die Erde bevölkert?•10 Minuten
    1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
    • Woche 3 Quiz•30 Minuten

    Dozenten

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    Pavel  Pevzner
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    Pavel  Pevzner
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    Phillip Compeau
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      Genomic Data Science

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    Felipe M.
    Lernender seit 2018
    „Es ist eine großartige Erfahrung, in meinem eigenen Tempo zu lernen. Ich kann lernen, wenn ich Zeit und Nerven dazu habe.“
    Jennifer J.
    Lernender seit 2020
    „Bei einem spannenden neuen Projekt konnte ich die neuen Kenntnisse und Kompetenzen aus den Kursen direkt bei der Arbeit anwenden.“
    Larry W.
    Lernender seit 2021
    „Wenn mir Kurse zu Themen fehlen, die meine Universität nicht anbietet, ist Coursera mit die beste Alternative.“
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    Z
    ZX
    5

    Geprüft am 21. Juli 2019

    In depth and comprehensive coverage of the topics in genetic data analysis.

    H
    HW
    5

    Geprüft am 10. Juni 2017

    the part about EM is the best I know, and first time I understand the EM algorithm.

    M
    MK
    5

    Geprüft am 11. Nov. 2018

    Absolutely fantastic course. Kudos to the course creators.

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